معرفی کتاب تکنیک pcr و نرم افزار fast pcr

[آرما]

کتاب تکنيک PCR و نرم افزار FAST PCR

کتابی علمی، کاربردی و آموزشی
این کتاب برای دانشجویان و دانش آموختگان و کلیه علاقمندان به رشته های بیوتکنولوژی، مهندسی ژنتیک، علوم پزشکی و علوم پایه بسیار مفید است.

در این کتاب می خوانیم:
v واکنش زنجیره ای پلیمراز PCR
v وسایل معرفها و مواد مصرفی
o وسایل
o انتخاب آنزیم
§ DNA پلیمراز
§ DNA پلیمرازهای VentTM
§ DNA پلیمراز Pfu
§ DNA پلیمرازTth
§ DNA پلیمراز U1TmaTM
§ DNA پلیمراز Pwo
o سایر معرفهای PCR
o داکسی نوکلئوزید تری فسفات
o بافرها و MgCl2
o مهارکنندگان و تشدیدکنندگان PCR
o DNA الگو
o پرایمرها
o طراحی پرایمر
o درجه حرارت ذوب پرایمرها
o نشاندارکردن پرایمر
o محاسبه غلظت پرایمر
o مواد مصرفی
v دستگاه مستر سایکلر
o منوی اصلی
o شروع
o فایلها
o گزینه ها
o اجرا
v نرم افزار FAST PCR
o ابزارها
§ تئوریها و فرمولها
§ Tm محصول
§ درجه حرارت مناسب آنیلینگ PCR
§ وزن مولکولی DNA
§ کیفیت پرایمر
§ اصل برنامه
§ فرایند طراحی پرایمر
§ طراحی پرایمرهای PCR
o گزینه هایی برای طراحی پرایمرها
§ گزینه طراحی پرایمر معمول
§ اجرای آنالیز و تفسیر نتیجه
§ طراحی پرایمر اختصاصی
§ محدودیت برای PCR چندتایی
§ طراحی پرایمرهای PCR گروهی- اختصاصی
§ طراحی پرایمر PCR با پایانه’3 ثابت پرایمر ( و جایگاه SNP)
§ بررسی پرایمرها برای سازگاری و پیش بینی درجه حرارت آنیلینگ
§ In silico PCR
o ابزارهای برنامه
§ ابزارهایی برای آنالیز پرایمرها از لیست

نرم افزار FAST PCR الگوهای اختصاصی آماده و متعددی را برای استفاده در تعیین توالی انواع PCR دارد:

ü PCR استاندارد، inverse و long پرایمرهای مناسب برای PCR، هیبریزیداسیون یا تعیین توالی را مشخص می سازد.
ü طراحی پرایمرهای Multiplex، طراحی سریع پرایمرها با آزمون دایمرهای متقاطع (هم واکنش) برای PCRهای بسیار حساس Multiplex.
ü طراحی پرایمرهای گروهی- اختصاصی PCR
ü PCR دژنره (پرایمرها مستقیماً از روی توالی آمینواسیدی طراحی می شوند).
ü In Silico PCR، پیش بینی محصولات احتمالی PCR و جستجوی موقعیت و جایگاههایی که پرایمر به طور نادرست جفت می شود.
ü ساختمانهای ثانویه پرایمرها، آنالیزهای پرایمر- دایمرهای خودی و دایمرهای متقاطع، همردیف سازی و محاسبه درجه حرارت های ذوب پرایمر
ü مشخص نمودن پرایمرهای کاذب، بررسی پرایمرهای متعدد آنیلینگ با استفاده از الگوریتم های همردیف سازی توالی
گردآوري و تدوين:

محمدرضا دهقاني، بيوتكنولوژيست پزشكي ازدانشگاه تربيت مدرس
با همکاری منیره هراتیان