ابزار جدید شناسایی آنتی بادی های قدرتمند hiv

به گزارش پژوهشکده مجازی بیوتکنولوژی پزشکی، تیمی متشکل از دانشمندان NIH ابزار جدیدی را برای شناسایی گسترده آنتی بادی های خنثی (bNAbs) توسعه دادند. این ابزار جدید، قادر است عفونت بسیاری از گونه های HIV را در سراسر جهان خنثی کند، پیشرفتی که می تواند به تسریع در تحقیقات واکسن HIV کمک کند. دانشمندان از مدت ها افراد مبتلا به HIV که خون آنها فعالیت قدرتمند خنثی سازی را نشان می داد را مورد مطالعه قرار دهند، چون درک رفتار bNAbs و نحوه حمله آنها به ویروس می تواند سرنخی برای طراحی واکسن HIV باشد. روش های در دسترس کنونی برای تحلیل نمونه های خونی، اطلاعات خاصی را در مورد حضور bNAbs و یا بخش هایی از ویروس که آنها مورد هدف قرار می دهند را ارائه نمی دهد. علاوه بر این، تعیین محل و نحوه اتصال bNAbs به این ویروس یک فرایند پر زحمت است که شامل چندین تکنیک پیچیده و مقادیر نسبتا زیادی از خون اهدا کنندگان می باشد. ابزار جدید این اجازه را می دهد تا دانشمندان دقیقا حضور bNAbs در یک نمونه خون خاص را توسط تجزیه و تحلیل گونه های HIV خنثی موجود در آن تعیین کنند. انگشت نگاری خنثی سازی (neutralization fingerprinting) یک ابزار الگوریتم ریاضی (روش حل مسئله) است که داده های زیادی در HIV bNAbs را بکار برد. انگشت نگاری خنثی سازی یک آنتی بادی HIV مقیاسی است برای اینکه کدام گونه ویروسی و با چه شدت می تواند مسدود شود. آنتی بادی هایی که بخش مشابه ای از یک ویروس را مورد هدف قرار دارند اثر انگشت مشابه ای هم دارند. نمونه های خون حاوی مخلوطی از آنتی بادی هستند، بنابراین الگوریتم جدید با مقایسه داده های خنثی سازی خون با اثر انگشت HIV bNAbs ، حضور انواع خاصی از HIV bNAbs وسهم هر یک را محاسبه می کند. این روش به ویژه زمانی مفید است که سایر روش های تعیین اهداف bNAbs در یک نمونه خون امکان پذیر نباشد، مانند زمانی که فقط مقدار کمی از خون موجود باشد. به گفته محققان، انگشت نگاری خنثی سازی به طور قابل توجهی سریع تر از روش های تحلیلی قدیمی تر است. این روش می تواند برای مطالعه پاسخ انسان نسبت به سایر عوامل پاتوژن مانند ویروس های آنفولانزا و هپاتیت C بکار رود. منبع: I. S. Georgiev, N. A. Doria-Rose, T. Zhou, Y. Do Kwon, R. P. Staupe, S. Moquin, G.-Y. Chuang, M. K. Louder, S. D. Schmidt, H. R. Altae-Tran, R. T. Bailer, K. McKee, M. Nason, S. O'Dell, G. Ofek, M. Pancera, S. Srivatsan, L. Shapiro, M. Connors, S. A. Migueles, L. Morris, Y. Nishimura, M. A. Martin, J. R. Mascola, P. D. Kwong. Delineating Antibody Recognition in Polyclonal Sera from Patterns of HIV-1 Isolate Neutralization. Science, 2013; 340 (6133): 751 DOI: 10.1126/science.1233989